Quelles sont les tâches du NARA ?

26.06.2025 - Le NARA recueille de toute la Suisse des bactéries à Gram négatif et positif multirésistantes. Ses principales tâches consistent à identifier les mécanismes de résistance correspondants, connus ou nouveaux, et à alerter les parties prenantes de toute menace importante sur le plan clinique. En outre, le centre assiste les laboratoires cliniques dans leur tâche de surveillance en développant des tests de diagnostic et en soutenant les enquêtes épidémiologiques au niveau national.

Par le passé, la Suisse a été considérée comme relativement épargnée par le problème de la résistance aux antibiotiques. Conformément aux tendances observées dans les pays voisins, un nombre croissant de souches bactériennes multirésistantes y a été isolé au cours de la dernière décennie. L’émergence de bactéries à Gram négatif résistantes, notamment, est devenue plus importante. L’isolement d’entérobactéries, de Pseudomonas aeruginosa et de Acinetobacter baumannii, qui produisent carbapénémase,des carbapénémases n’est en fait plus considéré comme inhabituel, notamment chez les patients admis dans les hôpitaux universitaires.

Le NARA a été créé en 2017 à Fribourg pour surveiller l’apparition et la propagation des bactéries multirésistantes (BMR) considérées comme des menaces majeures en Suisse, qu’elles soient isolées à partir d’infections (échantillons cliniques) ou de colonisation (p. ex. dépistage rectal ou nasal, selon l’espèce). En tant que laboratoire d’expertise centralisé, le NARA offre une opportunité unique de maintenir une surveillance continue des espèces bactériennes les plus préoccupantes et des mécanismes de résistance qui prolifèrent au niveau national ; il soutient ainsi les efforts visant à en prévenir et en contrôler la propagation.

Le NARA, un centre de référence spécialisé pour pister les « superbactéries* ».

En novembre 2024, l’Office fédéral de la santé publique (OFSP) a élargi le cadre du NARA en lui confiant une nouveau mandat. Outre l’unité de microbiologie médicale et moléculaire de l’Université de Fribourg, qui se concentre sur les bactéries à Gram négatif, et l’Institut de microbiologie du Centre hospitalier universitaire de Lausanne (CHUV), qui s’occupe des bactéries à Gram positif, un troisième partenaire est venu compléter le centre : l’Institut de microbiologie médicale (IMM) du Centre hospitalier universitaire de Zurich. Ce développement renforce les capacités de séquençage du NARA, en particulier dans les analyses génomiques, améliorant ainsi la surveillance épidémiologique moléculaire des bactéries multirésistantes (BMR). Par conséquent, l’épidémiologie moléculaire détaillée (p. ex., identifier les voies de transmission, identifier la propagation en milieu hospitalier ou au sein de la communauté) est renforcée. Les souches de BMR représentatives sont séquencées, contribuant ainsi à la biobanque suisse partagée entre les institutions publiques.

Dans le cadre de sa mission, le NARA poursuit différentes activités :

  • collecter des isolats de potentielles BMR pour identifier les mécanismes de résistance et constituer une biobanque des BMR circulant en Suisse ;
  • vérifier ou compléter les observations phénotypiques initiales (p. ex., confirmation du test de sensibilité, détermination des valeurs de concentration minimale inhibitrice [CMI]) telles que rapportées par les laboratoires de référence ;
  • évaluer et confirmer la nature des déterminants de la carbapénémase dans les bactéries à Gram négatif à l’aide de plusieurs techniques, notamment :
    • tests biochimiques (p. ex., test Carba NP pour la détection rapide de l’activité carbapénémase),
    • tests immunochromatographiques (pour l’identification des protéines),
    • techniques moléculaires telles que la PCR (pour détecter les gènes de résistance) ;
  • proposer des tests de sensibilité pour les nouveaux antibiotiques, en particulier lorsque les méthodes correspondantes ne sont pas encore disponibles dans les laboratoires de référence. Par exemple, NARA propose des tests CMI pour de nouvelles combinaisons d’inhibiteurs de β-lactamine/β-lactamase telles que l’aztréonam-avibactam (efficace contre les producteurs de métallo-β-lactamases), le ceftolozane-tazobactam, l’imipénem-relebactam, et le méropénem-vaborbactam. En raison du défi technique que représente la détermination des CMI pour la céphalosporine sidérophore céfidérocol (qui nécessite des milieux appauvris en fer), le NARA effectue également ces tests si nécessaire ;
  • développer des techniques de diagnostic rapide pour déterminer les profils de sensibilité/résistance pour les antibiotiques nouvellement disponibles. Ces outils visent à réduire le délai de réponse et à soutenir les décisions de traitement en temps opportun. Toutes les méthodes développées au NARA sont librement partagées avec les collègues sur demande ;
  • étudier les phénotypes de résistance inhabituels pour les bactéries à Gram positif, en particulier les staphylocoques et les entérocoques. Cela inclut des tests de sensibilité pour des médicaments tels que la teicoplanine, le linézolide et la daptomycine, et une caractérisation moléculaire des mécanismes de résistance si nécessaire ;
  • surveiller l’émergence et la propagation des mécanismes de résistance et de clones dans les hôpitaux et les cantons. La collecte d’isolats à l’échelle nationale permet au NARA de détecter des schémas de dissémination clonale ;
  • fournir des conseils médicaux d’experts pour la gestion des infections difficiles, y compris évaluer la pertinence des traitements standard sur la base de données in vitro ou suggérer des options thérapeutiques alternatives, y compris des antibiotiques moins conventionnels, sur la base de tests de sensibilité.

En résumé, les principales tâches du NARA consistent à aider les centres cliniques à évaluer la pertinence de nouveaux médicaments pour le traitement des infections BMR, en particulier celles causées par les producteurs de carbapénémases. Ce travail soutient l’identification des principales menaces de BMR en Suisse et contribue à la surveillance nationale en collaboration avec des organismes publics internationaux. En outre, en collaboration avec des partenaires tels que Swissnoso et ANRESIS, NARA facilite la détection, l’investigation et la gestion des épidémies potentielles impliquant des types spécifiques de souches bactériennes.

* « superbactérie » : une souche de bactérie devenue résistante aux médicaments antibiotiques et qui peut causer des infections difficiles à soigner.